Эта ошибка означает, что файлы должны отслеживаться LFS, но репозиторий не отслеживает их как LFS.
Попробуйте следующую последовательность команд:
git lfs uninstall
git reset --hard
git lfs install
git lfs pull
В случае, если это не работает (потому что это не сработало для меня), может сработать следующий хак:
git rm --cached -r .
git reset --hard
git rm .gitattributes
git reset .
git checkout .